204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4699 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  327  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0087  MarR family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.383416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0540  transcriptional regulator, MarR family  46.36 
 
 		 170 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0501  MarR family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 168 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3135  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0324  regulatory protein, MarR  43.24 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3908  transcriptional regulator, MarR family  43.88 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2144  MarR family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 177 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0843453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3280  MarR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 177 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  0.011902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2134  regulatory protein, MarR  35.81 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2290  transcriptional regulator, MarR family  35.81 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1790  transcriptional regulator, MarR family  26.39 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2140  regulatory protein, MarR  42.17 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2296  transcriptional regulator, MarR family  42.17 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  37.89 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 145 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  29.31 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  29.66 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  26.61 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  27.42 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  30.93 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  34.62 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  29.36 
 
 		 168 aa  47.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  29.76 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  26.27 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  31.48 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  26.67 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  27.46 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  28.18 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  33.8 
 
 		 154 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  36.23 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 141 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 151 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 151 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 154 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 154 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  29.57 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  27.78 
 
 		 157 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 150 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 150 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 150 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 150 aa  43.9  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  27.94 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>