More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1302 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  305  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  43.97 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  37.5 
 
 		 162 aa  110  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  39.06 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 145 aa  91.3  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 175 aa  90.5  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  42.5 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 304 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 140 aa  87  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  41.13 
 
 		 150 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  33.08 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  38.81 
 
 		 170 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  32.82 
 
 		 172 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  30 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 174 aa  67  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  36.45 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.48 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1979  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  30.16 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  29.25 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 309 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 307 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>