264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0087 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0087  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  345  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.383416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  53.95 
 
 		 160 aa  165  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0324  regulatory protein, MarR  44.94 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0501  MarR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0540  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 		 170 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3908  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3135  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2144  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0843453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3280  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  0.011902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2290  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 176 aa  85.1  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2134  regulatory protein, MarR  35.21 
 
 		 176 aa  85.1  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1790  transcriptional regulator, MarR family  25.85 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2140  regulatory protein, MarR  36.63 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2296  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  28.99 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  41.38 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  40.23 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  29.33 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  38.89 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  30.5 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  28.28 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 194 aa  51.2  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 194 aa  51.2  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  29.3 
 
 		 153 aa  50.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  29.7 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1292  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  26.5 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  24.37 
 
 		 154 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 161 aa  48.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 174 aa  47.8  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 143 aa  47.4  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  32.26 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  26.06 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  30.28 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  28.78 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  30.58 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>