221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2413 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
180 aa  362  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  97.22 
 
 
180 aa  355  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  96.67 
 
 
180 aa  353  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  96.67 
 
 
180 aa  353  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  46.71 
 
 
195 aa  141  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0501  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  29.37 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0540  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 
170 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0324  regulatory protein, MarR  22.92 
 
 
169 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0087  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
168 aa  58.2  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.383416 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  31.19 
 
 
162 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0879  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
152 aa  54.3  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.544594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0861  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
152 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 
152 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
152 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
152 aa  54.3  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
152 aa  54.3  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2144  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 
177 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0843453  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 
152 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
138 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 
152 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 
155 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2296  transcriptional regulator, MarR family  25.68 
 
 
173 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 
165 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3280  MarR family transcriptional regulator  21.8 
 
 
177 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  0.011902 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  24.65 
 
 
157 aa  52  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
152 aa  51.6  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
153 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2140  regulatory protein, MarR  26.09 
 
 
173 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1790  transcriptional regulator, MarR family  24.38 
 
 
174 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
141 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
141 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
141 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  27.42 
 
 
137 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  27.34 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3908  transcriptional regulator, MarR family  22.12 
 
 
195 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  24.75 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  27.2 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 
168 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4303  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 
152 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
139 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
157 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2643  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
211 aa  48.5  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
161 aa  48.9  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3135  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 
184 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 
142 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
168 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 
142 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  30.95 
 
 
201 aa  48.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 
149 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
153 aa  47.8  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
156 aa  48.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  29.73 
 
 
178 aa  47.8  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
181 aa  47.8  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  29.03 
 
 
158 aa  47.8  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
194 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
194 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 
143 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
180 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2391  transcriptional regulator, MarR family protein  27.68 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.515688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3618  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571227  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
139 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  32.73 
 
 
168 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  24.07 
 
 
143 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
157 aa  45.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  23.53 
 
 
157 aa  45.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 
174 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
139 aa  45.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 
277 aa  45.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  22.44 
 
 
172 aa  45.1  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
158 aa  45.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
165 aa  45.1  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 
165 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  26.12 
 
 
144 aa  44.7  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  22.88 
 
 
146 aa  44.7  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
148 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
155 aa  44.7  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 
148 aa  44.3  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
168 aa  44.3  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  23.48 
 
 
142 aa  44.3  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
142 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  23.65 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  21.9 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  29.11 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
315 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>