More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2119 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 157 aa  313  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  77.71 
 
 		 167 aa  248  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  78.98 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  75.8 
 
 		 180 aa  237  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  55.08 
 
 		 202 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  53.33 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  50.66 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  50.33 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  43.92 
 
 		 155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 189 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 189 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  42.11 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  42.07 
 
 		 147 aa  90.5  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  46.36 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  52.13 
 
 		 144 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  40.15 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 148 aa  85.1  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 182 aa  84.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  38.89 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1036  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0755699  normal  0.33215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  31.16 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  27.48 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  24.11 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  27.35 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  37.66 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  45.76 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  22.7 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  26.52 
 
 		 146 aa  50.8  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  31.73 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  32.32 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  25.47 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>