159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4073 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  100 
 
 		 147 aa  288  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  63.5 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  60 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  58.99 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  52.38 
 
 		 182 aa  119  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 155 aa  97.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 202 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  49.47 
 
 		 147 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  48.42 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 180 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 151 aa  92.8  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 179 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 189 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  52.22 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 189 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 189 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  44.55 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  52.87 
 
 		 172 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  51.72 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  39.44 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  39 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  46.55 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0109  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.701478  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 219 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 233 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  30.22 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 170 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  27.84 
 
 		 283 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  22.13 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  32.56 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  35.24 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  29.35 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  40.7 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  29.77 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1036  MarR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0755699  normal  0.33215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  41.51 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 168 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 159 aa  43.9  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.44 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  29.06 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  31.58 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0933  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.611634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  35.06 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1619  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00285215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  30.88 
 
 		 301 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1933  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  31.91 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  23.73 
 
 		 146 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 166 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  34.18 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>