95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1446 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  100 
 
 		 172 aa  332  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  98.77 
 
 		 163 aa  310  6.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  62.5 
 
 		 158 aa  157  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  49.69 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  60.68 
 
 		 202 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  49.28 
 
 		 157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  50.33 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 145 aa  125  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 179 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  58.04 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  42.57 
 
 		 182 aa  95.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 		 144 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 189 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 189 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  43.88 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  42.65 
 
 		 147 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  52.75 
 
 		 147 aa  88.6  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 148 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  39.53 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  31.25 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 		 301 aa  54.7  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1036  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 85 aa  52.4  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0755699  normal  0.33215 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  45.31 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 159 aa  50.8  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  33.61 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0283  hypothetical protein  25.23 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000125013  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 187 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 186 aa  47.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  26.89 
 
 		 175 aa  47.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 175 aa  47.4  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 158 aa  45.1  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 170 aa  44.7  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 168 aa  44.3  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0933  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.611634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1619  transcriptional regulator  24.11 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00285215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  32.5 
 
 		 135 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  25.83 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 162 aa  42  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 158 aa  42  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3223  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 145 aa  41.6  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 352 aa  41.2  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 182 aa  40.8  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 157 aa  41.2  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  32.93 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 158 aa  40.8  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  29.91 
 
 		 201 aa  40.8  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 158 aa  40.8  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 161 aa  40.8  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>