53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1560 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  313  7e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  34.44 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  36 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  35.79 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  31.25 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  41.05 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  35.96 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1865  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281666  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 322 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 310 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  32.47 
 
 		 283 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 146 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 151 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  25.71 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0378  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  22.73 
 
 		 157 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>