More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1865 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1865  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 177 aa  357  5e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281666  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  48 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1106  MarR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 185 aa  154  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.106479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18960  transcriptional regulator  43.53 
 
 		 181 aa  140  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0870752  normal  0.777873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  45.99 
 
 		 166 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7490  hypothetical protein  32.12 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7500  hypothetical protein  32.12 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  29.94 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  37.1 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  30.38 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0710  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0726  regulatory protein MarR  28.57 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0342  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  33.12 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  27.49 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2624  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000470188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4529  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000513075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  31.47 
 
 		 168 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  41.67 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  35.71 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  37.14 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  36.36 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1265  transcriptional regulator, MarR family  40.24 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000976075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  33.33 
 
 		 148 aa  52.8  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 303 aa  52  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 164 aa  51.6  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 149 aa  51.6  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  30.25 
 
 		 146 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 148 aa  51.6  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  30.25 
 
 		 146 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 160 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 161 aa  51.2  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 160 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 155 aa  50.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 138 aa  50.8  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  34.02 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  25.37 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  29.45 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  25.37 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  29.8 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>