150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0765 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  327  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  88.89 
 
 		 189 aa  288  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  89.51 
 
 		 189 aa  288  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  88.2 
 
 		 189 aa  287  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  87.84 
 
 		 148 aa  264  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  88.97 
 
 		 148 aa  263  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 179 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  48.57 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  49 
 
 		 202 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 167 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  42.76 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 154 aa  87.8  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 143 aa  87.4  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  44.04 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  50 
 
 		 172 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  48.91 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  40.46 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  36.03 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  39.69 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  38.89 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  42.53 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  33.1 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 223 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  34.72 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  22.79 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 157 aa  47.8  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 170 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  22.61 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  22.61 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  25.21 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  29.49 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26770  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  26.76 
 
 		 138 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  23.29 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  27.52 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  36.84 
 
 		 283 aa  43.9  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  26.5 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1619  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00285215  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  28.06 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  26.81 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0548  MarR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>