180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4875 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  300  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  98.65 
 
 		 148 aa  296  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  88.97 
 
 		 161 aa  263  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  85.81 
 
 		 189 aa  262  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  85.81 
 
 		 189 aa  261  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  85.14 
 
 		 189 aa  261  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 179 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  48.57 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 180 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 167 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  50.53 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  37.24 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  44.12 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  41.22 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  39.31 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  47.83 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  46.74 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  42.42 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  35.61 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  27.87 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 185 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  32.98 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  28.36 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0548  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  21.82 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 162 aa  45.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 223 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  25.23 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26770  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  21.82 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 303 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  21.5 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 180 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 180 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  25 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.78 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.78 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.78 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>