286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0737 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 322 aa  664    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  65.88 
 
 		 313 aa  408  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  62.08 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  58.49 
 
 		 352 aa  378  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  61.41 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  61.41 
 
 		 349 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  61.41 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  62.08 
 
 		 320 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  59.31 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  61.41 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  60.47 
 
 		 312 aa  353  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  58.68 
 
 		 326 aa  350  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  58.68 
 
 		 340 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  59.67 
 
 		 309 aa  347  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  55.29 
 
 		 301 aa  326  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  55.48 
 
 		 283 aa  325  4.0000000000000003e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  63.8 
 
 		 167 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  63.19 
 
 		 167 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  62.82 
 
 		 170 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  59.87 
 
 		 177 aa  202  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  59.87 
 
 		 167 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  59.87 
 
 		 167 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  59.87 
 
 		 167 aa  200  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  60.26 
 
 		 173 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  57.79 
 
 		 167 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  56.49 
 
 		 167 aa  193  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  62.03 
 
 		 167 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  62.03 
 
 		 167 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  62.03 
 
 		 167 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  62.03 
 
 		 167 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  62.03 
 
 		 167 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  63.8 
 
 		 167 aa  188  8e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  63.8 
 
 		 167 aa  188  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  63.8 
 
 		 167 aa  188  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  63.19 
 
 		 167 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  63.19 
 
 		 167 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  63.19 
 
 		 167 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  55.56 
 
 		 172 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  54.88 
 
 		 167 aa  179  8e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  57.69 
 
 		 167 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  45.96 
 
 		 161 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  44.3 
 
 		 163 aa  143  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  39.87 
 
 		 161 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  37.74 
 
 		 164 aa  122  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  36.31 
 
 		 161 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  33.33 
 
 		 160 aa  116  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  37.58 
 
 		 162 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  28.47 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  28.11 
 
 		 319 aa  96.3  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  27.7 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 307 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 326 aa  89.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 321 aa  89  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.44 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  25.93 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1339  acetyltransferase  33.97 
 
 		 157 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  22.44 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.82 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  21.71 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  32.19 
 
 		 159 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  32.19 
 
 		 159 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  25.52 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.37 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.44 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.08 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.47 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.32 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  22.73 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  32.12 
 
 		 164 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.26 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 		 169 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  34.31 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 150 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  22.73 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>