283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5761 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  100 
 
 
316 aa  655    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  62.97 
 
 
345 aa  424  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6080  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  58.86 
 
 
319 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0834  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  55.59 
 
 
318 aa  366  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0786078  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2571  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  40.75 
 
 
314 aa  235  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.808395  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
324 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  54.36 
 
 
160 aa  168  9e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
323 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4337  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
168 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.473125 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
327 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09031  transcriptional regulator, MarR family protein  44.74 
 
 
151 aa  129  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.151689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2927  GCN5-related N-acetyltransferase  44.52 
 
 
310 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4032  MarR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
161 aa  115  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 
161 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4636  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
166 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4590  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
156 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220277  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  36.11 
 
 
184 aa  95.9  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.45 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  24.38 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  23.99 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6449  transcriptional regulator, MarR family  26.03 
 
 
159 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  25.27 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.05 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  22.44 
 
 
349 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 
322 aa  63.2  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  23.99 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  23.99 
 
 
326 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  22.44 
 
 
349 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  21.4 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  24.33 
 
 
320 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  22.11 
 
 
347 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  23.66 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  22.77 
 
 
347 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  23.97 
 
 
307 aa  60.1  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  23.91 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  23.53 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  29.45 
 
 
160 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
166 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  27.01 
 
 
164 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  21.85 
 
 
283 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.38 
 
 
294 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  21.51 
 
 
312 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  22.85 
 
 
334 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  28.78 
 
 
161 aa  56.6  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4527  MarR family transcriptional regulator  23.18 
 
 
165 aa  56.6  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
167 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  34.55 
 
 
167 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  40 
 
 
167 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  34.55 
 
 
167 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
167 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  21.67 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 
146 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
170 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1670  putative acetyltransferase  36.17 
 
 
156 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  38.75 
 
 
167 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  38.75 
 
 
167 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  38.75 
 
 
167 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3540  regulatory protein MarR  24.31 
 
 
154 aa  53.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.074778  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 
172 aa  52.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
161 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  38.16 
 
 
167 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13454  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimI  39.47 
 
 
158 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00191083  hitchhiker  0.000645998 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  38.16 
 
 
167 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4357  transcriptional regulator, MarR family  24.2 
 
 
188 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  38.16 
 
 
167 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08700  acetyltransferase  44.26 
 
 
166 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
172 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  38.16 
 
 
167 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  27.16 
 
 
161 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  38.16 
 
 
167 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 
167 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
167 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
147 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0630  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.75 
 
 
188 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1253  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  24.06 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
163 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  21.32 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34630  acetyltransferase  40 
 
 
212 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
168 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  26.02 
 
 
165 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
171 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
171 aa  50.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  35.05 
 
 
161 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
145 aa  50.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
184 aa  50.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  21.15 
 
 
314 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04790  Predicted acetyltransferase  33.33 
 
 
152 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 
168 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1155  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.41 
 
 
145 aa  50.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 
167 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  34.48 
 
 
238 aa  50.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  35.35 
 
 
381 aa  50.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 
314 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  26.6 
 
 
157 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  32.39 
 
 
165 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
169 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  23.6 
 
 
290 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>