136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1657 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  92.26 
 
 		 174 aa  286  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  76.43 
 
 		 165 aa  246  8e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  72.9 
 
 		 161 aa  230  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  63.82 
 
 		 162 aa  206  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  63.82 
 
 		 162 aa  206  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  63.82 
 
 		 162 aa  206  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 162 aa  203  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  61.07 
 
 		 161 aa  189  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  38.68 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.6 
 
 		 316 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  31.93 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  31.36 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  39.39 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  32.65 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  30.49 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  32.98 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  29.82 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 201 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  29.06 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  28.3 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  29.75 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  25.32 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3177  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000202979  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  24.76 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 323 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  23.71 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  35.71 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 147 aa  44.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 159 aa  43.9  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 149 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 321 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2643  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  21.93 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 200 aa  42  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 180 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  23.44 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>