More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1054 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  100 
 
 
164 aa  340  4e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  63.12 
 
 
161 aa  221  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  59.38 
 
 
160 aa  213  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  40.25 
 
 
320 aa  136  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
313 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  39.49 
 
 
312 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  39.49 
 
 
349 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
347 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  38.85 
 
 
349 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  37.5 
 
 
283 aa  122  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
322 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
301 aa  121  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
340 aa  120  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  39.49 
 
 
347 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  39.35 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  40.65 
 
 
167 aa  117  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  40 
 
 
167 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  40 
 
 
167 aa  114  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
334 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  37.18 
 
 
167 aa  112  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  37.18 
 
 
167 aa  112  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
309 aa  110  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  36.65 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
352 aa  107  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  38.22 
 
 
163 aa  107  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
340 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
326 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  35.03 
 
 
162 aa  104  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
170 aa  103  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  38.61 
 
 
167 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  38.61 
 
 
167 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  38.61 
 
 
167 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  38.61 
 
 
167 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  38.61 
 
 
167 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  39.1 
 
 
172 aa  100  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
173 aa  99  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  37.42 
 
 
167 aa  97.1  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
307 aa  97.1  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
326 aa  95.5  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  37.18 
 
 
167 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  37.18 
 
 
167 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  37.18 
 
 
167 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  37.18 
 
 
167 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  37.18 
 
 
167 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  37.18 
 
 
167 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 
161 aa  91.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 
169 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  31.54 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  32.11 
 
 
171 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  32.11 
 
 
171 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4902  GCN5-related N-acetyltransferase  38.78 
 
 
195 aa  70.9  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185466  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5915  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  27.85 
 
 
238 aa  68.2  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 
175 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04790  Predicted acetyltransferase  26.81 
 
 
152 aa  67  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  28.8 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  30.37 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3535  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0151129 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1339  acetyltransferase  25.6 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  28.16 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  35.85 
 
 
387 aa  63.9  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1275  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308513  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 
162 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08700  acetyltransferase  46.77 
 
 
166 aa  62.4  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  33.88 
 
 
380 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
162 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.78 
 
 
322 aa  60.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 
154 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
157 aa  58.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.01 
 
 
316 aa  58.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.56 
 
 
310 aa  58.2  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0618  GCN5-related N-acetyltransferase  31.15 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.971308  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
305 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
307 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  30.09 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2033  acetyltransferase  28.3 
 
 
162 aa  54.7  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.832186  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0188  putative acetyltransferase  29.31 
 
 
169 aa  55.1  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340862  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3407  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
165 aa  54.7  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.204713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.43 
 
 
326 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2929  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
161 aa  54.7  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0333345  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  32.99 
 
 
153 aa  54.3  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  24.81 
 
 
155 aa  53.9  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  36.11 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2381  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.69 
 
 
312 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
316 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>