More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2487 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  100 
 
 
160 aa  328  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  59.38 
 
 
164 aa  213  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  58.13 
 
 
161 aa  207  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  39.87 
 
 
320 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  40.88 
 
 
283 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
313 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  38.22 
 
 
349 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
347 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
349 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
301 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  39.49 
 
 
347 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  38.99 
 
 
340 aa  124  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 
161 aa  122  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  38.85 
 
 
162 aa  120  8e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  39.13 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  33.76 
 
 
312 aa  118  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  38.51 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
309 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  37.34 
 
 
173 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
322 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  38.22 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  38.61 
 
 
167 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  37.11 
 
 
177 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  38.99 
 
 
340 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  38.99 
 
 
326 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
170 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  35.22 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  37.97 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  35.22 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  35.22 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  35.67 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  35.67 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  35.67 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  35.67 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  35.67 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
334 aa  107  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
167 aa  107  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
352 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  36.77 
 
 
326 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
307 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  39.75 
 
 
167 aa  101  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  39.75 
 
 
167 aa  101  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  39.75 
 
 
167 aa  101  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  39.13 
 
 
167 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  39.13 
 
 
167 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  39.13 
 
 
167 aa  99  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 
172 aa  99  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  35.22 
 
 
167 aa  97.4  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
161 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  32.28 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1339  acetyltransferase  26.88 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  25.95 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  26.81 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4902  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
314 aa  65.1  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  28.95 
 
 
387 aa  64.7  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 
166 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 
166 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  40.66 
 
 
320 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  33.64 
 
 
380 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  30.4 
 
 
160 aa  62.4  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  32.48 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1275  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
163 aa  62  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308513  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0188  putative acetyltransferase  28.78 
 
 
169 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340862  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  22.94 
 
 
184 aa  61.2  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
315 aa  61.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1897  acetyltransferase  27.7 
 
 
161 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.900785  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  30.33 
 
 
164 aa  60.5  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3224  acetyltransferase, GNAT family  28.38 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503052 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
154 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  28.83 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00551848  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3098  GCN5-related N-acetyltransferase  26.23 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2190  acetyltransferase, GNAT family  27.7 
 
 
161 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.600718  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.11 
 
 
322 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.46 
 
 
304 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
345 aa  58.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2081  acetyltransferase, GNAT family  27.7 
 
 
161 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.45 
 
 
316 aa  57.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
299 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3907  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 
203 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
310 aa  57.4  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.777166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>