More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1078 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  72.31 
 
 		 312 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 308 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  61.44 
 
 		 309 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 314 aa  311  6.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  52 
 
 		 326 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 314 aa  301  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  50.96 
 
 		 320 aa  299  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 315 aa  279  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  47.84 
 
 		 304 aa  277  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  45.85 
 
 		 309 aa  273  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  47.16 
 
 		 305 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  46.49 
 
 		 305 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  44.08 
 
 		 310 aa  255  7e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  43.92 
 
 		 308 aa  245  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 310 aa  244  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  42.86 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  37.54 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  33.22 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.46 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  51.66 
 
 		 163 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  49.06 
 
 		 162 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.14 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  44.3 
 
 		 161 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  42.58 
 
 		 161 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  42.58 
 
 		 161 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 		 143 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 326 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.95 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 336 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 337 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  24.5 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.54 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 322 aa  92.8  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 		 166 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.21 
 
 		 349 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 347 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.68 
 
 		 325 aa  87.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 349 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 352 aa  86.3  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.76 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  27.65 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2004  transcriptional regulator  31.85 
 
 		 142 aa  81.6  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.112591  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  28.19 
 
 		 848 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2226  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.05 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  24.33 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.3 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  24.11 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  34.07 
 
 		 149 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  22.34 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 168 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  21.31 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  41.56 
 
 		 186 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  27.34 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  27.34 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  29.23 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 171 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  26.81 
 
 		 212 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 157 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 153 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 165 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 164 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 166 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 163 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 155 aa  53.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 164 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 163 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>