More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3019 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  650    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  73.02 
 
 		 320 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 307 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  55.19 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 314 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  50.8 
 
 		 309 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  53.75 
 
 		 308 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 305 aa  315  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  51.5 
 
 		 304 aa  315  7e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  51.46 
 
 		 326 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  48.01 
 
 		 305 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  46.36 
 
 		 305 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 299 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  41.37 
 
 		 310 aa  256  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 310 aa  256  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  44.59 
 
 		 310 aa  255  6e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  46.03 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  41.31 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 308 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  42.24 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  38.56 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  34.11 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  38.01 
 
 		 318 aa  192  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  50.93 
 
 		 162 aa  172  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  52.7 
 
 		 163 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.69 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  39.6 
 
 		 161 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  36.77 
 
 		 161 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  36.77 
 
 		 161 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.22 
 
 		 289 aa  119  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  30.2 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  37.33 
 
 		 166 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.13 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  40.44 
 
 		 143 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 291 aa  99  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 290 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 		 162 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.25 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  30.87 
 
 		 848 aa  92.4  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.29 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2226  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.72 
 
 		 291 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 352 aa  86.7  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  29.03 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.87 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.39 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2004  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.112591  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  26.49 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  34.78 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  32.98 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  35.78 
 
 		 162 aa  65.5  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 155 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  21.99 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  33.93 
 
 		 173 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 		 212 aa  62  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  32.29 
 
 		 161 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  21.31 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  33.6 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 154 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  35.96 
 
 		 162 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  32.11 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1952  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 		 192 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.941364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 160 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1055  hypothetical protein  36.96 
 
 		 153 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 151 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 150 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 		 170 aa  54.3  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 		 167 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  33.01 
 
 		 164 aa  53.5  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 		 196 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  41.54 
 
 		 153 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>