More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1052 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  100 
 
 		 304 aa  613  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  61.79 
 
 		 305 aa  387  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  54.18 
 
 		 314 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  52.3 
 
 		 326 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  51.5 
 
 		 320 aa  309  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  51.5 
 
 		 316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  52.3 
 
 		 310 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 315 aa  289  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  50.17 
 
 		 312 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 314 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 308 aa  281  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  47.84 
 
 		 307 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  47.7 
 
 		 299 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  47.14 
 
 		 309 aa  267  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  44.11 
 
 		 308 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 307 aa  242  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 308 aa  242  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 310 aa  238  8e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  41.86 
 
 		 305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  44.27 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  41.2 
 
 		 305 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  43.15 
 
 		 317 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  39.6 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  55.63 
 
 		 163 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  49.68 
 
 		 162 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  29.02 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.07 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  40.41 
 
 		 161 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  38.06 
 
 		 161 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  38.06 
 
 		 161 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  26.4 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 326 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 337 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.3 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  39.55 
 
 		 143 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 336 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 326 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 326 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 326 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.76 
 
 		 289 aa  92.4  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  29.64 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 		 166 aa  89.4  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.18 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.74 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  30.28 
 
 		 848 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2226  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.91 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.72 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 		 162 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  27.52 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2004  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.112591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.32 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  36.47 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2524  hypothetical protein  35.54 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.210905 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  24.05 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  23.18 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  22.84 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 171 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  38.61 
 
 		 168 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 		 167 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 157 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  32.46 
 
 		 160 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  32.32 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 144 aa  57  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 149 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  32.32 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3801  GCN5-related N-acetyltransferase  25.48 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.54281  decreased coverage  0.000138892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>