213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0978 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
310 aa  620  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  61.79 
 
 
317 aa  344  8.999999999999999e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
314 aa  265  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
309 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  41.37 
 
 
316 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  44.12 
 
 
309 aa  245  6.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
305 aa  242  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  44.74 
 
 
326 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
307 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  43.39 
 
 
304 aa  238  9e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  40.68 
 
 
312 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  43.89 
 
 
314 aa  231  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  38.56 
 
 
320 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  40.67 
 
 
305 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  40.67 
 
 
305 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
315 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
308 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
308 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.92 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.05 
 
 
310 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
310 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
307 aa  185  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.08 
 
 
322 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  25.82 
 
 
306 aa  155  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  33.89 
 
 
318 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  44.03 
 
 
162 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
163 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.09 
 
 
311 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  26.49 
 
 
313 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
291 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
325 aa  95.9  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
326 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
291 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 
143 aa  92.4  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
326 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
326 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
326 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.93 
 
 
291 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  26.35 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.03 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  34.84 
 
 
161 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 
329 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  34.84 
 
 
161 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.09 
 
 
325 aa  86.7  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  30.38 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.27 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  26.3 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.82 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 
166 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2226  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.78 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326568  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
161 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  28.95 
 
 
848 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.18 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2004  transcriptional regulator  28.33 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.112591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  24.2 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  24.47 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  22.88 
 
 
352 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  23.19 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  23.84 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  23.84 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  24.2 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  24.34 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05970  acetyltransferase  32.14 
 
 
174 aa  55.8  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.410057  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1363  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
222 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
189 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  22.74 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  21.79 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
168 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3907  GCN5-related N-acetyltransferase  26.89 
 
 
203 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  24.3 
 
 
307 aa  53.1  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  31.53 
 
 
160 aa  53.1  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  33.7 
 
 
168 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  31.08 
 
 
163 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  37.84 
 
 
184 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  25.09 
 
 
301 aa  50.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
165 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
163 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
146 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  20.33 
 
 
319 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1709  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
165 aa  49.7  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.674932  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  20.33 
 
 
319 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1275  GCN5-related N-acetyltransferase  31.72 
 
 
163 aa  48.9  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308513  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  34.62 
 
 
143 aa  48.9  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  24.67 
 
 
162 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
157 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
157 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 
150 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3663  GCN5-related N-acetyltransferase  47.54 
 
 
162 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173126  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 
151 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
155 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
157 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>