173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2189 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  100 
 
 		 325 aa  658    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  55.49 
 
 		 321 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  53.75 
 
 		 337 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  52.27 
 
 		 313 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 329 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 326 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 326 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 326 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 326 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  46.35 
 
 		 325 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 321 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 336 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  26.91 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.56 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 		 309 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.47 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.06 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.03 
 
 		 326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.47 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.3 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.92 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.76 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  26.58 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  25.91 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  32.05 
 
 		 848 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.21 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 340 aa  87  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 310 aa  86.7  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 349 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.82 
 
 		 349 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  27.8 
 
 		 318 aa  85.9  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 		 166 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.76 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  27.85 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 		 162 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  25.43 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  24.44 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01922  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  43.24 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0828281  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 141 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 141 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.42 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  27.59 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2004  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.112591  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4636  GCN5-related N-acetyltransferase  32.99 
 
 		 166 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.23 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  31.69 
 
 		 148 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 184 aa  53.9  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 148 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3260  acetyltransferase  37.76 
 
 		 168 aa  53.5  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3735  transcriptional regulator, MarR family  49.09 
 
 		 366 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.090934  normal  0.79067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4589  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 167 aa  52.8  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 162 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3450  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 		 172 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 147 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 146 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  31.63 
 
 		 160 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.4 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  20.8 
 
 		 143 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 159 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 150 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3801  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 		 172 aa  49.7  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.54281  decreased coverage  0.000138892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2343  acetyltransferase  33.75 
 
 		 152 aa  49.7  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4189  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 		 216 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0390403  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  24.67 
 
 		 290 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  20.29 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  39.08 
 
 		 184 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 147 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 		 163 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 178 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>