218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2131 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 162 aa  333  5e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 316 aa  97.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.33 
 
 		 320 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 309 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 314 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.58 
 
 		 326 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 305 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  34.16 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.12 
 
 		 312 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.3 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.92 
 
 		 322 aa  74.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.07 
 
 		 304 aa  71.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 315 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  29.49 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 299 aa  68.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 		 309 aa  67.4  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.5 
 
 		 305 aa  63.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 321 aa  62  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 326 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.25 
 
 		 305 aa  60.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 310 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  28.66 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 325 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 336 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 326 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 326 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.71 
 
 		 308 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 307 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.77 
 
 		 325 aa  52  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2322  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 178 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 322 aa  50.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  31.78 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.14 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  33.98 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  34.75 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0771  GCN5-related N-acetyltransferase  34.02 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  28.03 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  30.58 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1810  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 		 251 aa  48.9  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000508978  normal  0.534907 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 310 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  28.68 
 
 		 848 aa  48.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1757  GCN5-related N-acetyltransferase  36.79 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1783  acetyltransferase  31.39 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 337 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2954  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 		 145 aa  47.8  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1410  GCN5-related N-acetyltransferase  25.26 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  28.17 
 
 		 313 aa  47.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 290 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  32.76 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  44.64 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.03 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0178817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  44.07 
 
 		 327 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  32.76 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0553  acetyltransferase  30.83 
 
 		 273 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0569  acetyltransferase  30.83 
 
 		 273 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1453  acetyltransferase  27.45 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  32.2 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1472  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0103  acetyltransferase  30.83 
 
 		 273 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.864372  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1486  acetyltransferase  30.83 
 
 		 273 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2915  acetyltransferase  30.83 
 
 		 273 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0486  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 		 270 aa  45.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 320 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  42.86 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  42.86 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  42.86 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  31.16 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5542  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  42.86 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  42.86 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 		 151 aa  44.7  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  31.03 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3590  GCN5-related protein N-acetyltransferase  34.07 
 
 		 322 aa  44.3  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  43.64 
 
 		 312 aa  44.3  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>