More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1223 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  100 
 
 		 312 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  72.31 
 
 		 307 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  69 
 
 		 308 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  62.67 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 316 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 314 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 314 aa  315  9e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  53.23 
 
 		 326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  52.48 
 
 		 320 aa  298  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  50.17 
 
 		 304 aa  288  7e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  48.81 
 
 		 305 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 305 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  46.82 
 
 		 305 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 315 aa  279  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  47.84 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  44.81 
 
 		 309 aa  262  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 310 aa  260  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  44.7 
 
 		 310 aa  258  7e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  45.08 
 
 		 322 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  42.91 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 310 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  41.91 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  33.44 
 
 		 306 aa  198  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.13 
 
 		 317 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  54.3 
 
 		 163 aa  172  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  52.2 
 
 		 162 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.49 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  44.3 
 
 		 161 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  42.58 
 
 		 161 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  42.58 
 
 		 161 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 326 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 326 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.76 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  26.76 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.54 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 		 143 aa  99.8  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.62 
 
 		 289 aa  95.5  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 337 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 166 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.18 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 320 aa  89.4  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.06 
 
 		 349 aa  89  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 347 aa  89  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  26.45 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 322 aa  89  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 352 aa  86.7  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 349 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.47 
 
 		 291 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 		 162 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  29.53 
 
 		 848 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2004  transcriptional regulator  27.94 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.112591  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  26.69 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2226  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.12 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  28.79 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  28.79 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 155 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 155 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  37.78 
 
 		 167 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  37.61 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 178 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  21.51 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 145 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 149 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  31.39 
 
 		 161 aa  55.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 155 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  32.52 
 
 		 167 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 154 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  40.96 
 
 		 167 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 187 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.53 
 
 		 156 aa  53.9  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  27.69 
 
 		 164 aa  53.9  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 148 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>