291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3945 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  298  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  39.86 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  33.58 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1625  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  31.39 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  30.37 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  27.74 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 304 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  26.43 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  32.03 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.43 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3781  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  26.92 
 
 		 168 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  33.59 
 
 		 170 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>