78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3781 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3781  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  338  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  28.06 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 152 aa  51.2  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1696  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  38.2 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 209 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 304 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4161  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000235966  normal  0.7718 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  29.57 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  32.74 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  23.01 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2804  MarR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000371866  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  24 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  32.04 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3268  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  27.46 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  29.81 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 154 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  27.85 
 
 		 163 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  24.62 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 156 aa  42  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 144 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  22.33 
 
 		 193 aa  42  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 156 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  27.38 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3318  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 141 aa  41.6  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213533  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 142 aa  41.6  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1316  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.061965 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  30.39 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  24.06 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 		 165 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 304 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 168 aa  40.8  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 158 aa  40.8  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  22.83 
 
 		 149 aa  40.8  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>