139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4161 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4161  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000235966  normal  0.7718 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 223 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  26.76 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  25.71 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  25.24 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  25.19 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1389  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000012285  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  26.14 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  20.74 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3592  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  19.85 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3781  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  25 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  21.32 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  28.75 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  25.49 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1316  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.061965 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  27.27 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  25.45 
 
 		 198 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1495  MarR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 150 aa  43.9  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  24.3 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  21.54 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  24.77 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  24.73 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 162 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02788  putative transcriptional regulator (MarR family) protein  27.91 
 
 		 109 aa  42.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 147 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>