More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1429 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 198 aa  390  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 223 aa  157  9e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  35.78 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 141 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 168 aa  62  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  34.06 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 158 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  30.48 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  30.71 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  31.47 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  34.29 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  31.86 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 147 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 183 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 151 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 176 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 147 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 172 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 172 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  36.28 
 
 		 162 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 146 aa  51.6  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 172 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 172 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 334 aa  51.2  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  25.71 
 
 		 151 aa  51.2  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 172 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 148 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0353  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases-like protein  27.78 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 137 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 140 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  30.28 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  29.32 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 157 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 150 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  24.77 
 
 		 142 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 162 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 139 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 162 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 138 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 138 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 138 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 143 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 138 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>