More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2076 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  283  7e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  79.14 
 
 		 139 aa  220  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  72.66 
 
 		 139 aa  217  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  70.07 
 
 		 153 aa  201  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  70.8 
 
 		 149 aa  201  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  70.07 
 
 		 159 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  70.07 
 
 		 168 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  70.07 
 
 		 159 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  70.07 
 
 		 154 aa  201  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  71.53 
 
 		 153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  71.53 
 
 		 153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  71.53 
 
 		 153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  68.38 
 
 		 137 aa  189  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  55.97 
 
 		 138 aa  164  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 138 aa  160  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  56.93 
 
 		 138 aa  160  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  54.55 
 
 		 135 aa  158  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  59.54 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 142 aa  130  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 220 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  38.89 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 		 174 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  34.94 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 152 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 152 aa  52  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 173 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>