More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0452 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  54.2 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 142 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 138 aa  105  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 139 aa  103  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 149 aa  103  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 154 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  39.52 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  35.77 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  37.04 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 220 aa  80.1  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 154 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  32.43 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  27.55 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  29 
 
 		 174 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 168 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003893  transcriptional regulator  25 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  29.2 
 
 		 163 aa  52.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 158 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>