216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003893 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003893  transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  308  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01757  hypothetical protein  80.54 
 
 		 150 aa  254  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1554  regulatory protein MarR  34.59 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  28.93 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  30.68 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 173 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  26.23 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 145 aa  50.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  28.71 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  25.41 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  31.18 
 
 		 287 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  29.13 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  29.13 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  29.13 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  29.13 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  26.28 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  29.13 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  29.13 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  25.22 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  29.13 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  28.7 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.7 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  28.33 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  31.31 
 
 		 176 aa  47.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  29.13 
 
 		 176 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 303 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1332  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 167 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  23.78 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  30 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4454  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  27.83 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4541  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.786222  normal  0.801932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>