More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1208 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 147 aa  293  7e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  92.52 
 
 		 147 aa  273  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3450  MarR family transcriptional regulator  74.82 
 
 		 151 aa  194  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  42.71 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  45.08 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  32.06 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  27.07 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  27.07 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 169 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  37.82 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32.98 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32.98 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  31.06 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5185  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  29.31 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  28.46 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  34.29 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  31.45 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 		 139 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 139 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 163 aa  50.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 139 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 296 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>