More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0820 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  298  1e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  29.7 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 182 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 152 aa  50.8  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  34.09 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 165 aa  50.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  27.93 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  26.89 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  33.02 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  29.11 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  32.89 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  28.07 
 
 		 144 aa  47.8  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 176 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  27.52 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 208 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  24.3 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 163 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>