More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0229 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  310  3.9999999999999997e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  56.62 
 
 		 144 aa  156  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  47.86 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  44.07 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  39.57 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0440  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 157 aa  60.1  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  26.4 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  35.71 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 176 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0096  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 161 aa  50.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  25.6 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  37.21 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5459  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.5362 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  30.34 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  35.53 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  34.33 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  36.49 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  46.15 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  26.67 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  32.14 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  29.41 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  33.7 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.86 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  44.07 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  34.38 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  27.71 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>