More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0992 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  303  4.0000000000000004e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 144 aa  120  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  37.4 
 
 		 161 aa  86.7  9e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  25.86 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 165 aa  62  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  22.96 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  29.82 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0871  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0438869  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0096  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_774  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.489268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  25.22 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  22.03 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  25.85 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>