250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1297 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 157 aa  304  4.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  41.84 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  38.74 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  34.85 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  37.37 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0378  transcriptional regulator, MarR family  39.08 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  38.38 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 127 aa  51.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 177 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 139 aa  50.8  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  36.92 
 
 		 152 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  34.65 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0346  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.668512  normal  0.0212996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 152 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 171 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  40.86 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  48.98 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1599  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276188  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0285  transcriptional regulator, MarR family  23.97 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.742627  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  33.93 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0096  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  26.67 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1786  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  36.99 
 
 		 287 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 309 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  30.77 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>