More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0346 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0346  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  344  3e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.668512  normal  0.0212996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  52.94 
 
 		 139 aa  120  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  45.87 
 
 		 163 aa  91.3  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  36.88 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 163 aa  85.1  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  44.96 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0053  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3177  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000202979  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2410  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.83816  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  27.45 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33.58 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 172 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 172 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  27.84 
 
 		 161 aa  51.2  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  32.8 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  24.74 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 307 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  41.54 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3588  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  22.48 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  38 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 137 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 194 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 158 aa  47.8  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 156 aa  47.4  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 158 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  33.91 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  44.93 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  39.62 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3223  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  54.55 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6002  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431751  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4194  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  39.68 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  34 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  51.06 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  26.8 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  35 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  28.36 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  44.07 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>