192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1889 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  382  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  46.07 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  41 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  30.6 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  37.7 
 
 		 160 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  35.45 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  36.72 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 142 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1639  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 161 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  37.62 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 158 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  33.73 
 
 		 151 aa  52  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  33.73 
 
 		 151 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 187 aa  51.6  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 159 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  34 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  26.95 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 159 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  35.85 
 
 		 169 aa  48.9  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 142 aa  48.9  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 161 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  38.89 
 
 		 143 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 150 aa  48.5  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  37.76 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 168 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 161 aa  48.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 149 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 158 aa  48.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  29.58 
 
 		 162 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 147 aa  47.8  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 147 aa  47.8  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  33.02 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4277  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  25.78 
 
 		 283 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3696  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  26.8 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  25.77 
 
 		 150 aa  46.2  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  26.21 
 
 		 141 aa  46.2  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 156 aa  45.8  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 146 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 147 aa  45.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 148 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 158 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 152 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  27.93 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  34.02 
 
 		 140 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 143 aa  45.4  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 143 aa  45.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  45.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 171 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 171 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>