More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4619 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  100 
 
 		 143 aa  275  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  41.22 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  38.73 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  35.62 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  34.06 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  40.2 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.88 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  39.18 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  35.24 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1639  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 188 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  31.65 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 193 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  47.06 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  31.53 
 
 		 169 aa  51.2  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  39.77 
 
 		 173 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 182 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 158 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  37.11 
 
 		 157 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  37.11 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  33.78 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  42.31 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  33.93 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  36.56 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 307 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 233 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  25.25 
 
 		 150 aa  48.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  45.24 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30 
 
 		 325 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>