268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3511 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 142 aa  276  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 172 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  46.27 
 
 		 174 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  52.63 
 
 		 154 aa  123  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  49.64 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  40.15 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  40.46 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1639  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 161 aa  73.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  39.62 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  42.98 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  35.88 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  37.86 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  41.82 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  38.17 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  39.17 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  35.85 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  42.35 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  40.7 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 172 aa  53.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 192 aa  53.5  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  39.29 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  32.33 
 
 		 165 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  42.37 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0283  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  45.35 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  24.19 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3725  regulatory protein MarR  37.14 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1863  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0934368  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  40.51 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  45.9 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>