More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0465 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 201 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 158 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 172 aa  62  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 175 aa  62  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  35.94 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  34.51 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  50.65 
 
 		 154 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  41.56 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  30.48 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  46.27 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  34.45 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 153 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0501  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 168 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  34.4 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  41.38 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 151 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  40.66 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  37.66 
 
 		 149 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 142 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 165 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 165 aa  52.4  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 148 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 153 aa  51.6  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 156 aa  51.2  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  34.58 
 
 		 132 aa  51.2  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  38.26 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0374  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 250 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 142 aa  51.2  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  38.03 
 
 		 132 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 142 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  30.49 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  37.21 
 
 		 153 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 167 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 137 aa  49.7  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  29.86 
 
 		 156 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 142 aa  49.3  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 158 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  33.12 
 
 		 277 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 147 aa  48.9  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 167 aa  48.9  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  37.93 
 
 		 154 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  48.5  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 148 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 135 aa  48.5  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 149 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 168 aa  48.5  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 150 aa  48.5  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 166 aa  48.5  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 164 aa  48.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 157 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 147 aa  48.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  43.02 
 
 		 169 aa  48.1  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  26.36 
 
 		 144 aa  48.1  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  29.66 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 161 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 156 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 155 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  35.42 
 
 		 140 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 270 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>