205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2629 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
135 aa  270  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  61.9 
 
 
151 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  62.9 
 
 
158 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  62.9 
 
 
158 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  62.9 
 
 
137 aa  157  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  62.9 
 
 
137 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  61.83 
 
 
137 aa  156  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  61.83 
 
 
151 aa  156  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  61.83 
 
 
137 aa  156  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  61.07 
 
 
137 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  61.07 
 
 
141 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  61.07 
 
 
141 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  61.07 
 
 
141 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  60.31 
 
 
160 aa  154  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  62.6 
 
 
137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  61.29 
 
 
152 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  61.6 
 
 
139 aa  153  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  61.29 
 
 
137 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  61.29 
 
 
137 aa  150  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  59.06 
 
 
160 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  60.98 
 
 
137 aa  147  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  58.06 
 
 
169 aa  146  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  56.25 
 
 
141 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  57.72 
 
 
138 aa  142  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  57.6 
 
 
145 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  57.6 
 
 
145 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  53.08 
 
 
139 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  63.71 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  53.72 
 
 
139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  51.26 
 
 
277 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
156 aa  115  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
141 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 
149 aa  97.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  46.36 
 
 
162 aa  97.1  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  40.65 
 
 
148 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  40.77 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  41.82 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  36.29 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
173 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 
167 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  42.47 
 
 
171 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  42.22 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  30.09 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 
201 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
152 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  40.45 
 
 
168 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  32.04 
 
 
187 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1790  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 
174 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
167 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  45.95 
 
 
149 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
147 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
159 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
180 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  51.06 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
180 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  34.09 
 
 
145 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  32.8 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  42.62 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  27.88 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 
172 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  34.18 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 
171 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  30.69 
 
 
172 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  51.11 
 
 
185 aa  43.5  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  34.78 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>