181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0374 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0374  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  495  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 192 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 191 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 191 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  45.05 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  42.71 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  38.14 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  41 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 166 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 168 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  45.28 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  38.61 
 
 		 166 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 176 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 176 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  34.58 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2254  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0799585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 178 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2559  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  39.39 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  35 
 
 		 163 aa  62  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 194 aa  62  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 164 aa  62  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  37.63 
 
 		 162 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5309  Transcriptional regulator  32.81 
 
 		 165 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00683555  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  46.48 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1049  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.51 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.51 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  37.36 
 
 		 164 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.75 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.51 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.51 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.51 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.75 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.75 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.75 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.75 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.75 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3754  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.852787  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.91 
 
 		 144 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  36.05 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  36.05 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  41.84 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4886  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1159  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 166 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.462298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 148 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 		 174 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 165 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  33.91 
 
 		 175 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 175 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 173 aa  52.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>