More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0411 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 139 aa  267  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  60.45 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 143 aa  87.4  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  41.73 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  38.85 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  46.15 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  38.76 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  38.4 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  44.55 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  42.45 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  39.01 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  35.58 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  39.26 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  41.28 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 171 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 171 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4301  MarR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  36.7 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  38.89 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  36.09 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 187 aa  57  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  49.35 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  41.56 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  32.82 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  34.26 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  35.14 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  38.95 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  36.45 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  34.53 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>