291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3216 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 174 aa  344  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  76.65 
 
 		 167 aa  248  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  76.65 
 
 		 167 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  76.05 
 
 		 167 aa  246  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  74.85 
 
 		 167 aa  244  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  74.85 
 
 		 167 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  79.72 
 
 		 147 aa  230  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 160 aa  207  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  68.75 
 
 		 160 aa  207  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 160 aa  207  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 160 aa  207  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 160 aa  207  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 160 aa  207  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  60.25 
 
 		 166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  48.89 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  46.62 
 
 		 154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  48.7 
 
 		 166 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  41.96 
 
 		 149 aa  94.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  37.01 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  34.19 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 147 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.24 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.24 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.24 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.24 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.24 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.13 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.13 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.13 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.13 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.13 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.13 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  26.32 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  30.16 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  26.32 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  30.71 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3041  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3121  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  35.92 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  22.81 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  35.63 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 219 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4279  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 209 aa  51.6  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 145 aa  51.2  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 146 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 146 aa  50.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>