115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3121 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3121  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 193 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  30.3 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2043  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.831784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  34.23 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  21.37 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  28.3 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  33.96 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 147 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 167 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 167 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  31.36 
 
 		 159 aa  51.6  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 167 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 167 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 166 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 139 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 168 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 162 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 162 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 157 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 155 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  30.25 
 
 		 154 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 152 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 163 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  25.76 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  34.19 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 162 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 162 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  33.62 
 
 		 137 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  24.79 
 
 		 141 aa  45.1  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 166 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 154 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 167 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 140 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 139 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 		 167 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  25.4 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 151 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  30.14 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  24.35 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  22.89 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  30.08 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  23.89 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 157 aa  43.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  30.14 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3177  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 151 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000202979  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0346  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.668512  normal  0.0212996 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  22.95 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  21.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 143 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1639  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>