278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1055 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  323  6e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  100 
 
 		 160 aa  323  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  323  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  323  6e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  323  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  323  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  72.05 
 
 		 167 aa  221  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  72.22 
 
 		 167 aa  220  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  71.6 
 
 		 167 aa  217  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  71.6 
 
 		 167 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  74.83 
 
 		 167 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  75 
 
 		 147 aa  213  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 174 aa  207  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  66.19 
 
 		 166 aa  192  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  49.68 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  48.89 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  41.74 
 
 		 149 aa  96.3  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  47.92 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  30.5 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  30.09 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  35.64 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.7 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.7 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.7 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.7 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.7 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 209 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3121  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 193 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3177  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000202979  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  32.14 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 151 aa  50.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3041  MarR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03120  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.489584  hitchhiker  0.0000000819923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  28.16 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  28.16 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>