271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0278 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 175 aa  333  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 159 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 156 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  45.26 
 
 		 150 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 156 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  48.15 
 
 		 150 aa  117  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 150 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 147 aa  95.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 151 aa  94.4  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 151 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 147 aa  90.5  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 151 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 151 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 151 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 140 aa  87.8  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 150 aa  87.4  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 151 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 159 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  41.96 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  44.95 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  42.96 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  36.55 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  36.81 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 143 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 143 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 143 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3272  transcriptional regulator, MarR family  42.15 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  41.1 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  40.37 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  37.69 
 
 		 145 aa  67.4  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0728  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  36.04 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  38.41 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  39.78 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0378  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 154 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1259  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1269  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1242  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474925  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  37.27 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  32.77 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 189 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 152 aa  52  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>