More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3271 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  305  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  62.68 
 
 		 168 aa  183  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  58.94 
 
 		 171 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  58.94 
 
 		 171 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  58.33 
 
 		 157 aa  174  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  58.45 
 
 		 174 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  59.44 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  54.48 
 
 		 158 aa  161  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 184 aa  155  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  39.82 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  42.4 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  32.03 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 		 214 aa  74.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  41.51 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  31.2 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  33.62 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  33.98 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2187  hypothetical protein  31.3 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0800441  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  31.58 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  32.08 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  22.95 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1639  transcriptional regulator, MarR family  26.89 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  39.02 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  38.71 
 
 		 208 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 303 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3121  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  34.41 
 
 		 134 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  34.41 
 
 		 134 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  34.41 
 
 		 134 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  34.41 
 
 		 134 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  34.41 
 
 		 134 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>