31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2187 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2187  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  343  5e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0800441  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
155 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
150 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
154 aa  48.5  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  34.86 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  29.22 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  32.53 
 
 
135 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  30.4 
 
 
139 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  21.79 
 
 
171 aa  44.7  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  25 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
201 aa  42.4  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
169 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  42  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  27.7 
 
 
158 aa  42  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  27.7 
 
 
183 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  28.92 
 
 
162 aa  40.8  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
181 aa  40.8  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>