219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0934 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  608  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 170 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 151 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 174 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  35.76 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 153 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0580  PilT domain-containing protein  35.94 
 
 		 137 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 161 aa  77.8  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3611  PilT domain-containing protein  35.07 
 
 		 135 aa  77.4  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235155  normal  0.0281309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 150 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 155 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 151 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4271  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0321554  normal  0.0832297 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4025  hypothetical protein  34.33 
 
 		 131 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3055  hypothetical protein  34.62 
 
 		 137 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 150 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2508  PilT protein domain protein  31.06 
 
 		 138 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2888  PIN domain protein  31.06 
 
 		 138 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0769801  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 184 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4188  hypothetical protein  32.84 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199772  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0984  PilT protein-like  31.25 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 162 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 172 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 185 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 158 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 133 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 148 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 157 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 157 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2164  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 182 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  29.71 
 
 		 162 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 183 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 171 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 149 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 150 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 136 aa  53.5  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 161 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 139 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 193 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 136 aa  53.1  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 155 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 163 aa  52.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 148 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 148 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 148 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 172 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 137 aa  52.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 139 aa  52.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 139 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 157 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  32.21 
 
 		 172 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 151 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 163 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 155 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 151 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 163 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 163 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 156 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 163 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 170 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 139 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 139 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 139 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 151 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3341  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 158 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3973  PilT protein domain protein  30.83 
 
 		 134 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 150 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 142 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 164 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 142 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  33.98 
 
 		 178 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 167 aa  50.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>